第1集

　　FBI特工亚历山大·麦霍恩(Alexander Mahone)受命调查、追踪福克斯（FOX）监狱犯人越狱案，对几名逃犯的资料一一过目，听说迈克尔·斯考菲尔德是行动的主谋后，亚历山大对他的资料格外注意。在新闻发布会上，麦霍恩举出过去的案例，号召全美国的人都来关注受到通缉的八名逃犯。　　怒火冲天的贝里克带领一群狱警和警犬追赶着迈克尔等人来到一条铁道边，凭借火车的掩护，迈克尔他们终于暂时摆脱了贝里克。惊魂稍定后，几个人开始抱怨阿布兹的飞机失约，“便条”提到了威斯特莫兰的500万美元，迈克尔打断了他的话头。　　麦霍恩询问监狱长波普，萨拉在整个越狱事件中扮演的角色，波普告诉他：“她现在不能回答任何问题”，原来注射了过量毒品的萨拉深度昏迷，戴着呼吸机生死未卜，但是在她意识最深处，与迈克尔相处的情景一幕幕闪现，画面越跳越快，萨拉突然醒来，深吸了一口气。　　受伤的“T-Bag”一处野营地发现了一桶冰块正好用来保存他被斩下的断手，然后继续踉跄上路。麦霍恩决定从迈克尔的纹身入手进行调查，贝里克对他的介入不以为然。　　维罗妮卡被困在蒙大拿布莱克斯通的房屋中，她想努力说服泰伦斯摆脱遭人软禁的环境，为整个事件画上句号。泰伦斯告诉她自己只能在这里苟延残喘。维罗妮卡用手机报警，泰伦斯没有过多阻拦。　　“T-Bag”来到一家私人诊所，用螺丝刀逼迫医生马文·古达特为他施行断手再植手术。　　迈克尔告诉林肯阿布兹的飞机只是计划之一，自己在Ripe Chance Woods另留了一手。FBI总部，麦霍恩与纹身师谈过话后，开始了解迈克尔纹身隐藏下的计划。迈克尔等人被一对父女发现行踪，阿布兹以小女孩相要协，一行人抢得汽车逃离。迈克尔告诉“便条”他们的下个目的地是奥斯维戈。麦霍恩来到迈克尔居住过的旧屋，试图从遗留下的蛛丝马迹中探究他的思路。贝里克从信用卡纪录中获得线索，率众亦赶往奥斯维戈，寻找迈克尔租下的仓库。迈克尔等人拿着铁锹等工具正欲离开，贝里克荷枪实弹守在仓库门外，大门被骤然拉开，里面却空无一物，贝里克再次被耍，气急败坏，麦霍恩意识到Ripe Chance Woods是一个人名。此时迈克尔等人来到一座公墓，挖出他早先埋藏好的衣物，穿戴一新。麦霍恩也随之赶到，但几人混入人群难以被发现。一群警察赶到泰伦斯的寓所，正与林肯通话的维罗妮卡没料到她等来的是一枚射入眉心的子弹。萨拉从护士凯蒂给她带来的包中发现一张纸鹤，上面是迈克尔留给她的便条。

第2集

　　麦霍恩接到通知，加拿大和墨西哥边境已经收到了通缉令，将提高警戒，严防八名逃犯越过国境线。　　迈克尔打扮得像个大学生，坐在公园长椅子上，乘人不备偷回了大包食物，与苏克雷、“便条”和阿布兹等人美餐一顿后，五个人分道扬镳。林肯从报纸上看到儿子听证会即将开庭的消息，执意要潜入法院救出儿子，迈克尔反对无效，只得顺从林肯的主意。　　在古达特医生的诊所，“T-Bag”的断手再接术终于完成，为防止医生报警，“T-Bag”给其注射了药剂，并染了头发，他开走医生的汽车，踏上前往犹他州之路。　　贝里克和监狱长波普被排除追捕逃犯的行动之外，并就越狱事件接受上级调查。被辞退的狱警高里出面作证，证实贝里克接受了阿布兹的贿赂，才让几个参与越狱的犯人有机会在警卫室打出地洞。监狱长波普被扣薪，贝里克遭到解职，波普为贝里克鸣不平，愤然提出辞职。贝里克回到家中，颓废沮丧的他一度产生自杀的念头，但是得知林肯等人的悬赏金有数十万之多，他决心开始追踪这群让他丢了工作又蒙受羞辱的人。　　小偷图纳想买票前往尤他，看到报纸上的通缉令他惊慌失措地跑出车站，在一块公告牌上他找到了拼车前往尤他州的一个女孩名字。　　林肯冒充律师给儿子LJ打电话，提醒他自己会想法营救他，他们的电话却遭到了录音。麦霍恩询问LJ电话内容一无所获，LJ被押走前，麦霍恩突然意识到了什么，挤进电梯提出亲自押送LJ。果然迈克尔和林肯从电梯顶现身，用枪指住他的头，要LJ下了他的佩枪。他们把LJ往上提的时候，枪掉了下来，麦霍恩抓住了LJ，不让他逃走。眼看营救无望，林肯万般无奈地松开了儿子。麦霍恩制住LJ，通知警卫立刻上楼顶去抓迈克尔和林肯。逃跑过程中，林肯腿部中弹，流血不止。

第3集

　　调查员们赶到了车祸现场，检查着烧焦的轮胎，车体残骸。一名医官充满感情地哀叹：“这个人冒着生命危险越狱，结果一出狱就死在了车轮底下。”马霍没有表情地问：“出事的是他们中哪一个？”　　画面闪回到12小时之前。福克斯大河监狱的逃犯照片被放大了挂在墙上，朗警官踱来踱去：“我们在所有的医院布下了天罗地网。只要他们敢进去索要药品，绷带也好，消炎药也好，我们就准能抓住他们。而且，我们也在监视逃犯的家人，但目前为止一无所获。”马霍赞同地点头：“世上有几件事是无可避免的：死亡，纳税，所有的逃犯在逃亡生涯最初的72小时之内必定会犯错。他们要逃得更远一点，就得去偷车；要现金用，就会去抢劫商店；因为需要帮助，就会错信不该相信的人。只要他们犯下以上的错误，就等于把双手绑着回到了监狱。”　　麦克的妻子妮卡听到前门有急促的敲门声，连忙去开门。门口站着麦克和虚弱的林肯，林肯身上还在滴血。“你得帮我。”麦克扶着哥哥进了房间，让妮卡去找下列东西：“胡椒粉，跌打伤酒，毛巾，止痛药。”“再来点酒。”林肯替他说完。妮卡慌乱地搜着屋子。麦克把林肯的伤腿放平，给他上药。林肯疼得一缩，说：“我们得赶快走。”麦克说，这条腿如果不止住血，他们根本走不出伊利诺斯州。他盯着哥哥：“你得忍着点。”接着把酒精直接倒在了林肯腿上的枪伤处。林肯疼得有些发昏，连忙又喝了一口妮克拿来的伏特加酒。麦克拿起胡椒粉，撒在林肯的腿上，说：“这可以帮你消肿。”林肯疼昏过去。妮克责怪麦克不该来找她，警察已经在她家附近埋伏几天了，就等着要捉拿麦克。麦克说自己别无选择。　　麦克把林肯的腿包扎好，让妮克照看他，自己出去找车。林肯有气无力地说：“算了，别找那车了，我们再偷一部好了。”但麦克需要找回那部车，因为里面有他和林肯逃亡需要的各种东西。他回到五金店旁边的小巷里，但那部车无影无踪了。麦克一边想着可能发生的情况，一边慢慢地蹲下去，捡起来一片碎玻璃。他的视线落在自己手腕上的刺青处。那是监狱里的一个号码，写着38 312 1037。