第1集

　　宣祖惩治反贼郑汝立1605年，“惩毖录”作者柳成龙带病书写历史，当年的抗倭名将李将军带领战士们浴血奋战以少胜多。柳成龙写完一部份内容已是体力不支，虚弱的身体令柳成龙忍不住轻咳几声。时间回到1589年，宣祖顺利成为新任皇帝，登位之时宣祖准备举行大典，柳成龙对宣祖举行大典的方式颇有微词，一个官员跟柳成龙产生争执，两人 当着宣祖的面互不相让，另外一个官员主动提出新的建议供宣祖参考，宣祖觉得提出新建议的官员的想法不错，当场同意采纳官员的新建议。柳成龙见宣祖采用其它新建议，心中升起失落退朝离去。宣祖登基不久不太愿意跟其它邦国来往，柳成龙不赞成宣祖的立场，极力劝说宣祖跟其它邦国建 立来往，宣祖被柳成龙逼得没有办法只得同意跟其它邦国来往，虽然同意跟其它邦国来往，但宣祖要求柳成龙不能给其它邦国的来使带领部队进入本国国土中。跟柳成龙谈完国事宣祖回到寝宫，皇后见宣祖心情烦恼，脸上升起关怀盘问宣祖遇到了什么不开心的事情。关白抓到了平义，平义和另外一个伙伴被关白押到院子里面，关白杀气腾腾看着平义的伙伴，关白的一个手下拿起一把长剑杀死了平义的伙伴，平义看着伙伴死在当场，脸上升起惶恐担心自己也要被杀死。关白数落手下人在院子里面杀人，干净的院子因为死了人沾上了腥风血雨，关白一边数落手下一边离开院子，平义被关白的手下押到房间里面。关白没有打算杀害平义，而是希望平义能传话给宣祖，平义唯唯诺诺不敢反对关白的要求，关白提醒平义如何不按照他的指示办事，所有族人都要被屠杀。叮嘱完了平义，关白离开房间扬长而去，关白的手下蹲下身子将沾在剑上的血涂到平义脸上，平义吓得噤若寒蝉不敢吭声。倭寇侵犯宣祖的国土，沿海百姓被倭寇杀死打伤无数，许多百姓在混乱中逃跑，一个妇女抱着一个孩子想逃走，一名倭寇举起长剑捅死妇女，妇女抱着怀中的孩子倒在地上再也没有爬起来。宣祖得知沿海百姓被倭寇入侵，心中愈发坚定不跟日本国家建交，朝中一部份大臣希望宣祖能跟日本建交，一部份大臣反对宣祖跟日本建交，反对宣祖跟日本建交的大臣来到殿外跪拜宣祖，希望用实际行动阻止宣祖跟日本建交。民间跟宫中同样分出两派，一派支持宣祖跟日本建交，另外一派反对宣祖跟日本建交，两派的百姓聚集在一起谈论跟日本建交的事情，双方一言不和产生冲突然。宣祖被是否跟日本建交的问题搅得心烦意乱，许多官员跪在殿外希望宣祖能给个明确的立场，宣祖打开房门出现在官员们面前，官员们个个跪在地上希望宣祖能表态，宣祖愁眉苦脸看着所有官员一时之间不知如何是好。平义代表日本拜见宣祖，宣祖接见平义的时候提起倭寇，倭寇时常在宣祖的国界烧杀抢掠，宣祖一脸敌意不想跟平义交好，平义找宣祖的目的就是想代表 日本跟宣祖的国家建交，宣祖不太相信平义的为人，平义提醒宣祖不要把倭寇和日本混为一谈，虽然倭寇属于日本人，但不代表是日本国家的行为。宣祖见平义说得有几分道理，计上心来要求平义放掉之前被倭寇们绑走的百姓们，平义的伙伴觉得宣祖的要求太高，平义为了能跟宣祖和平谈判同意事后 救回被倭寇绑走的百姓们。平义的伙伴见平义夸下海口向宣祖做出保证，吃了一惊心急如焚看着平义。在伙伴的注视下平义面色平静没有一丝紧张的神色，看起来像 是非常有信心能帮宣祖救回被倭寇绑走的百姓。郑汝立造反，宣祖派出手下人捉拿郑汝立，郑汝立不久之后被宣祖派出的人杀害，其它跟郑汝立关系好的朋友都被宣祖调查，一些身居要职的官员曾经跟郑汝立计划一起造反，宣祖彻查了许多身居要职的官员。柳成长得知宣祖为了查办郑汝立惩治其它官员，心中升起不安来到殿外想拜见宣祖，宣祖坐在殿中不想跟柳成龙见面，柳成龙跪在殿外呼喊宣祖的名号， 宣祖坐在殿内不肯宣见柳成龙，柳成龙跪在地上不肯离去，一声接一声呼喊宣祖，宣祖坐在殿内已是心乱如麻，柳成龙跪在殿外一声接一声呼喊宣祖。

第2集

　　郑澈利用郑汝立事件大肆抓捕拷问东人党官员，郑彦信郑彦智等人落马。东人领袖李山海准备辞职退隐来躲避灾祸。柳成龙穿着白衣跪席恳求宣祖为了国家和百姓平息党争。宣祖感受到柳成龙的忠诚，承诺不再扩大打击东人官员。然而西人党却趁势掌握了朝廷实权。不久，宣祖在校场察看了鸟铳和弓箭两种武器的优劣。柳成龙献上了朝鲜自主发明的武器飞击震天雷。另一方面，宗义智回到日本后，向丰臣秀吉转达了朝鲜派遣通信使的条件。因对朝意见的不同，小西行长与加藤清正发生了争执。丰臣秀吉表示只要朝鲜协助日本攻打明朝，就不会侵略朝鲜。此时，丰臣秀吉的侧室夫人淀殿为秀吉生下了儿子鹤松。丰臣秀吉非常高兴。在庆祝儿子诞生的时候，秀吉过去的敌人柴田胜家的余党突然刺杀秀吉，但被加藤清正阻止。而在朝鲜，宗义智把朝鲜叛徒沙火同交给了朝鲜朝廷，希望朝鲜能尽快派遣通信使赴日。而一同来朝的日本间谍却打探到了飞击震天雷这种武器的情报。

韩剧惩毖录第3集剧情介绍

　　沙火同交待了日本细作潜伏朝鲜的情报。柳成龙凭借此情报，派出申砬将军去捉拿间谍。

　　柳成龙和申砬识破了金蝉脱壳之计，终于在济物浦击毙了日本细作，夺回了飞击震天雷的设计图。

　　宣祖因此决定向日本派出通信使。与此同时，日本小田原城的大名北条氏政叛乱，丰臣秀吉调动兵马平叛。

　　秀吉表达了日后利用小西行长侵略朝鲜的想法。因为通信使问题，西人党利用日本细作的事件，发起公论企图将柳成龙赶下台。

　　宣祖被朝臣党争气得病倒，引起了王子临海君的不满。

　　不料宣祖却偷偷派人将西人党的谋士宋翼弼抓获，并斥责了郑澈发动党争的行为。

　　而柳成龙却在此时明白，当初利用郑汝立事件打击东人党的幕后黑手竟是宣祖本人。