第13集

　　山田幸助带兵封锁了整个基地，并逐个房间搜查，众人藏匿的日军尸体险些被其发觉，所幸有人暗中锁住了实验室的门，而樱木一郎也因为自己的实验被打扰大为不悦，将山田挺进队赶出基地。众人逃过一劫之后百思不得其解。直到苏先生出现，方才知道是武工队暗中出手相助。苏先生及其队员早已潜入基地多时并挖好了地道。众人决定在夜里营救被困百姓并拿到日军实行反人道实验的关键证据。而另一方面山田幸之助也并不死心，准备在夜里悄悄杀一个回马枪。夜，众人成功将被困的百姓转移，不想龚传文却迟迟不归，关威无奈只得带人出去寻找。众人藏匿的尸体被日军发现，为了帮助关威争取时间，苏先生坚持不肯撤退，在基地内与日军展开激战。关威在实验室里找到了被樱木一郎绊住的龚传文。就在众人准备击毙樱木一郎时，山田幸助带人赶到，救走了樱木一郎，同时包围了关威一行三人。一声枪响打破了实验室内的僵局，山田幸助被窗外的武工队员击伤。关威等人趁机翻窗而逃。基地内，战斗仍在继续，苏先生在带领众人突围时身受重伤。关威受武工队之托带苏先生先行撤离，撤退途中罗如海、马三等队员接连出现，一番激战过后众人寡不敌众被日军团团包围，危急时刻冷傲雪和陆小雅挟持着樱木一郎来到日军阵前将众人救走。逃亡路上，史勇处决了杀人不眨眼的生化魔头樱木一郎。苏先生因伤势过重不幸壮烈牺牲，牺牲前苏先生对关威晓以大义，并将武工队交到了关威的手中。众人看着逝去的英雄沉默不言，史勇郑重的向着苏先生敬了一个军礼。夜，关威反复思考苏先生的教诲，立誓要成为像苏先生一样优秀的共产党人。众人抵达驻地，关威放走了发誓改过自新的汉奸泥鳅，并正式将神勇突击队与武工队合并命名为神勇武工队。

第14集

　　泥鳅逃回县城，不慎被史小拿所擒。山田幸助逼问泥鳅关威等人的下落，泥鳅贪生怕死，将关于关威的情报一一抖出。山田幸助升任泥鳅为保安队副队长。神勇突击队与武工队合并，史勇认为国共有别坚持要走。在关威的游说下，史勇答应为武工队完成军事训练后再走。众人从秘密基地中带出了大量日军反人道试验的证据，武工队副队长赵猛欲将证据交给一名即将被日军遣返回国的美国牧师，由其将证据带回美国，以便在国际上曝光日寇残暴的真实面目。关威与赵猛就行动计划展开激烈的争论，最终关威拿出代理队长的身份强行要求主导此次任务。经过一番努力后，罗如海成功说服了美国牧师在3日后的复活节配合众人的行动计划。在行动之前，关威准备抓紧时间将训练提上日程。武工队内新老两派队员为教官人选暗暗较劲，最终关威决定两队各派史勇，赵猛作为代表，择优录取。山田幸助担心日军秘密实验照片外流，要求松下惠取消美国牧师的遣返令，并对其严加监视，与此同时美国牧师坚持要求在复活节当日外出采购物品的行为也引起了松下惠的警觉。武工队的训练如火如荼的进行着，训练期间赵猛对关威等人极为严苛，同时对关威的行动计划也提出诸多质疑。二人一言不合发生激烈争吵。关威认为赵猛是心中不服自己这个队长，故意给自己难堪。赵猛认为关威的行为，对不起苏先生当初的牺牲。争吵过后赵猛想起苏先生牺牲时要自己帮助关威的嘱托，决定在护送美国牧师时，带领武工队的老队员在暗处策应。复活节当日，松下惠在城中布下了天罗地网，静候关威的到来。赵勇带领老队员进城，发现关威行动地点附近已被日军封锁的水泄不通，根本无法接近。赵猛情急之下带队偷袭山田幸助所在的野战医院，迫使松下惠亲自分兵带队支援。随着关威一声令下，战斗的序幕悄然拉开。

第15集

　　因为赵猛的牵制，关威带领新队员们成功将美国牧师护送出成。不想赵猛却在撤退途中寡不敌众，痛失一臂。关威得意洋洋回到驻地，被武工队的老队员痛斥，在得知道赵猛断臂之事后方才得知道自己闯下了弥天大祸，愧疚不已。两个月后，赵猛归队。苏先生祭日，关威在苏先生墓前真诚向赵猛道歉，二人摒弃前嫌，真正成为了生死与共的战友。关威开始认识到了纪律和革命信仰对武工队的重要性，带头虚心接受赵猛的训练指导，整个武工队的军事素质和精神面貌都焕然一新。经过众人商议，众人决定拿日军征粮队练兵。此次战斗众人第一次配合无间，大获全胜。全灭征粮队标志着神勇武工队正式走向成熟，此时作为教官的史勇却决定功成身退。与此同时，山田幸助又开始酝酿新一轮的阴谋，这次他的目标是关威的老家——史家镇。山田派兵大举进驻史家镇，并以全镇人的性命要挟关威投降。原来日军已在史家镇重新建立秘密生化基地，现在万事具备，只差樱木一郎生前的试验资料。山田知道关威有着过目不忘的记忆力，这份资料一定还保存在关威的脑海中。这种武器一但研发出来将会对战局产生决定性的影响。面对山田的威胁，众人开始苦苦思索破局之法。